From cd58939d37ea3dabc37447b786f450725ee8a68a Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: luoxiang <2806718453@qq.com> Date: Fri, 24 May 2019 00:12:29 +0800 Subject: [PATCH] modify --- README.md | 2 +- notes/SparkSQL外部数据源.md | 380 +++++++++++++++++++++++++++++++ notes/SparkSQL数据源支持.md | 14 -- 3 files changed, 381 insertions(+), 15 deletions(-) create mode 100644 notes/SparkSQL外部数据源.md delete mode 100644 notes/SparkSQL数据源支持.md diff --git a/README.md b/README.md index 026f438..644d3e8 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -83,7 +83,7 @@ 1. [DateFrames 和 DataSets ](https://github.com/heibaiying/BigData-Notes/blob/master/notes/SparkSQL_Dataset和DataFrame简介.md) 2. [Structured API的基本使用](https://github.com/heibaiying/BigData-Notes/blob/master/notes/Spark_Structured_API的基本使用.md) -3. [Spark SQL数据源] +3. [Spark SQL外部数据源](https://github.com/heibaiying/BigData-Notes/blob/master/notes/SparkSQL外部数据源.md) 4. [Spark SQL常用聚合函数](https://github.com/heibaiying/BigData-Notes/blob/master/notes/SparkSQL常用聚合函数.md) 5. [Spark SQL JOIN 操作](https://github.com/heibaiying/BigData-Notes/blob/master/notes/SparkSQL联结操作.md) diff --git a/notes/SparkSQL外部数据源.md b/notes/SparkSQL外部数据源.md new file mode 100644 index 0000000..f7939ff --- /dev/null +++ b/notes/SparkSQL外部数据源.md @@ -0,0 +1,380 @@ +# Spark SQL 外部数据源 + +## 一、简介 + +### 1.1 多数据源支持 + +Spark支持以下六个核心数据源，同时Spark社区还提供了多达上百种数据源的读取方式，能够满足绝大部分使用场景。 + +- CSV +- JSON +- Parquet +- ORC +- JDBC/ODBC connections +- Plain-text files + +### 1.2 读数据格式 + +所有数据源读取API都遵循以下调用格式： + +```scala +// 格式 +DataFrameReader.format(...).option("key", "value").schema(...).load() + +// 示例 +spark.read.format("csv") +.option("mode", "FAILFAST") // 读取模式 +.option("inferSchema", "true") // 是否自动推断schema +.option("path", "path/to/file(s)") // 文件路径 +.schema(someSchema) // 使用预定义的schema +.load() +``` + +读取模式有以下三种可选项： + +| 读模式 | 描述 | +| --------------- | ------------------------------------------------------------ | +| `permissive` | 当遇到损坏的记录时，将其所有字段设置为null，并将所有损坏的记录放在名为_corruption t_record的字符串列中 | +| `dropMalformed` | 删除格式不正确的行 | +| `failFast` | 遇到格式不正确的数据时立即失败 | + +### 1.3 写数据格式 + +```scala +// 格式 +DataFrameWriter.format(...).option(...).partitionBy(...).bucketBy(...).sortBy( +...).save() + +//示例 +dataframe.write.format("csv") +.option("mode", "OVERWRITE") //写模式 +.option("dateFormat", "yyyy-MM-dd") +.option("path", "path/to/file(s)") +.save() +``` + +| Scala/Java | 描述 | +| :--------------------------------- | :----------------------------------------------------------- | +| `SaveMode.ErrorIfExists`(默认模式) | 如果给定的路径已经存在文件，则抛出异常，这是写数据默认的模式 | +| `SaveMode.Append` | 数据以追加的方式写入 | +| `SaveMode.Overwrite` | 数据以覆盖的方式写入 | +| `SaveMode.Ignore` | Ignore mode means that when saving a DataFrame to a data source, if data already exists, the save operation is expected not to save the contents of the DataFrame and not to change the existing data. This is similar to a `CREATE TABLE IF NOT EXISTS` in SQL. | + + + +## 二、CSV + +CSV是一种常见的文本文件格式，其中每一行表示一条记录，记录中的每个字段用逗号分隔。 + +### 2.1 读取CSV文件 + +自动推断类型： + +```scala +spark.read.format("csv") +.option("header", "true") +.option("mode", "FAILFAST") +.option("inferSchema", "true") +.load("some/path/to/file.csv") +``` + +使用预定义类型： + +```scala +import org.apache.spark.sql.types.{StructField, StructType, StringType, +LongType} +val myManualSchema = new StructType(Array( +new StructField("DEST_COUNTRY_NAME", StringType, true), +new StructField("ORIGIN_COUNTRY_NAME", StringType, true), +new StructField("count", LongType, false) +)) +spark.read.format("csv") +.option("header", "true") +.option("mode", "FAILFAST") +.schema(myManualSchema) +.load("/data/flight-data/csv/2010-summary.csv") +.show(5) +``` + +### 2.2 写入CSV文件 + +```scala +import org.apache.spark.sql.types.{StructField, StructType, StringType, +LongType} +val myManualSchema = new StructType(Array( +new StructField("DEST_COUNTRY_NAME", StringType, true), +new StructField("ORIGIN_COUNTRY_NAME", StringType, true), +new StructField("count", LongType, false) +)) +spark.read.format("csv") +.option("header", "true") +.option("mode", "FAILFAST") +.schema(myManualSchema) +.load("/data/flight-data/csv/2010-summary.csv") +.show(5) +``` + +将csv文件，转换为tsv文件： + +```scala +csvFile.write.format("csv").mode("overwrite").option("sep", "\t") +.save("/tmp/my-tsv-file.tsv") +``` + +## 三、JSON + +### 3.1 读取JSON文件 + +```json +spark.read.format("json").option("mode", "FAILFAST").schema(myManualSchema) +.load("/data/flight-data/json/2010-summary.json").show(5) +``` + +### 3.2 写入JSON文件 + +```scala +csvFile.write.format("json").mode("overwrite").save("/tmp/my-json-file.json") +``` + +## 四、Parquet + + Parquet是一个开源的面向列的数据存储，它提供了多种存储优化，允许读取单独的列非整个文件，这不仅节省了存储空间而且提升了读取效率，它是Spark是默认的文件格式。 + +### 4.1 读取Parquet文件 + +```scala +spark.read.format("parquet") +.load("/data/flight-data/parquet/2010-summary.parquet").show(5) +``` + +需要注意的是：默认不支持一条数据记录跨越多行，可以通过配置`multiLine`为`true`来进行更改，其默认值为`false`。 + +### 2.2 写入Parquet文件 + +```scala +csvFile.write.format("parquet").mode("overwrite") +.save("/tmp/my-parquet-file.parquet") +``` + +### 2.3 可选配置 + +Parquet文件有着自己的存储规则，因此其可选配置项比较少，常用的有如下两个： + +| 读写操作 | 配置项 | 可选值 | 默认值 | 描述 | +| -------- | -------------------- | ------------------------------------------------------------ | ------------------------------------------- | ------------------------------------------------------------ | +| 读 | compression or codec | None,
uncompressed,
bzip2,
deflate, gzip,
lz4, or snappy | None | 压缩文件格式 | +| Read | mergeSchema | true, false | 取决于配置项`spark.sql.parquet.mergeSchema` | 当为真时，Parquet数据源将从所有数据文件收集的Schema合并在一起，否则将从摘要文件中选择Schema，如果没有可用的摘要文件，则从随机数据文件中选择Schema。 | + +> 完整的配置列表可以参阅官方文档：https://spark.apache.org/docs/latest/sql-data-sources-parquet.html + +## 五、ORC + +ORC是一种自描述的、类型感知的列文件格式，它针对大型数据的读取进行了优化，也是大数据中常用的文件格式。 + +### 5.1 读取ORC文件 + +```scala +spark.read.format("orc").load("/data/flight-data/orc/2010-summary.orc").show(5) +``` + +### 4.2 写入ORC文件 + +```scala +csvFile.write.format("orc").mode("overwrite").save("/tmp/my-json-file.orc") +``` + +## 六、SQL Databases + +spark同样支持与传统的关系型数据库进行数据读写。 + +### 6.1 获取数据库连接 + +```scala +import java.sql.DriverManager +val connection = DriverManager.getConnection(url) +connection.isClosed() +connection.close() +``` + +### 6.2 读取数据 + +读取全表数据： + +```scala +val pgDF = spark.read +.format("jdbc") +.option("driver", "org.postgresql.Driver") +.option("url", "jdbc:postgresql://database_server") +.option("dbtable", "schema.tablename") +.option("user", "username").option("password","my-secret-password").load() +``` + +读取过滤后的数据： + +```scala +val pushdownQuery = """(SELECT DISTINCT(DEST_COUNTRY_NAME) FROM flight_info) +AS flight_info""" +val dbDataFrame = spark.read.format("jdbc") +.option("url", url).option("dbtable", pushdownQuery).option("driver", driver) +.load() +``` + +```scala +val props = new java.util.Properties +props.setProperty("driver", "org.sqlite.JDBC") +val predicates = Array( +"DEST_COUNTRY_NAME != 'Sweden' OR ORIGIN_COUNTRY_NAME != 'Sweden'", +"DEST_COUNTRY_NAME != 'Anguilla' OR ORIGIN_COUNTRY_NAME != 'Anguilla'") +spark.read.jdbc(url, tablename, predicates, props).count() // 510 +``` + +并行读取数据： + +```scala +val dbDataFrame = spark.read.format("jdbc") +.option("url", url).option("dbtable", tablename).option("driver", driver) +.option("numPartitions", 10).load() +``` + +在这里，我们对第一个分区和最后一个分区分别指定了最小值和最大值。任何超出这些界限的都在第一个分区或最后一个分区中。然后，我们设置希望的分区总数(这是并行度的级别)。 + +```scala +val colName = "count" +val lowerBound = 0L +val upperBound = 348113L // this is the max count in our database +val numPartitions = 10 +spark.read.jdbc(url,tablename,colName,lowerBound,upperBound,numPartitions,props) +.count() // 255 +``` + + + +### 6.3 写入数据 + +```scala +val newPath = "jdbc:sqlite://tmp/my-sqlite.db" +csvFile.write.mode("overwrite").jdbc(newPath, tablename, props) +``` + +## 七、Text + +### 7.1 读取Text数据 + +```scala +spark.read.textFile("/data/flight-data/csv/2010-summary.csv") +.selectExpr("split(value, ',') as rows").show() +``` + +### 7.2 写入Text数据 + +```scala +csvFile.select("DEST_COUNTRY_NAME").write.text("/tmp/simple-text-file.txt") +``` + +## 八、数据读写高级概念 + +### 8.1 并行读 + +多个executors不能同时读取同一个文件，但它们可以同时读取不同的文件。一般来说，这意味着当您从一个包含多个文件的文件夹中读取数据时，这些文件中的每一个都将成为DataFrame中的一个分区，并由可用的executors并行读取。 + +### 8.2 并行写 + +写入的文件或数据的数量取决于写入数据时DataFrame拥有的分区数量。默认情况下，每个数据分区写一个文件。 + +### 8.3 分区写入 + +```scala +csvFile.limit(10).write.mode("overwrite").partitionBy("DEST_COUNTRY_NAME") +.save("/tmp/partitioned-files.parquet") +``` + +### 8.3 分桶写入 + +```scala +val numberBuckets = 10 +val columnToBucketBy = "count" +csvFile.write.format("parquet").mode("overwrite").bucketBy(numberBuckets, columnToBucketBy).saveAsTable("bucketedFiles") +``` + +### 8.5 文件大小管理 + +如果写入产生大量小文件，这时会产生大量的元数据开销。Spark和HDFS一样，都不能很好的处理这个问题，这被称为“small file problem”。同时数据文件也不能过大，否则在查询时会有不必要的性能开销，因此要把文件大小控制在一个合理的范围内。 + +在上文我们已经介绍过可以通过分区数量来控制生成文件的数量，从而间接控制文件大小。Spark 2.2引入了一种新的方法，以更自动化的方式控制文件大小，这就是`maxRecordsPerFile`参数，它允许你通过控制写入文件的记录数来控制文件大小。 + +```scala + // Spark将确保文件最多包含5000条记录 + df.write.option(“maxRecordsPerFile”, 5000) +``` + + + + + +## 九、附录 + +### 9.1 CSV读写可选配置 + +| 读\写操作 | 配置项 | 可选值 | 默认值 | 描述 | +| --------- | --------------------------- | ------------------------------------------------------------ | -------------------------- | ------------------------------------------------------------ | +| Both | seq | 任意字符 | `,`(逗号) | 分隔符 | +| Both | header | true, false | false | 文件中的第一行是否为列的名称。 | +| Read | escape | 任意字符 | \ | 转义字符 | +| Read | inferSchema | true, false | false | 是否自动推断列类型 | +| Read | ignoreLeadingWhiteSpace | true, false | false | 是否跳过值前面的空格 | +| Both | ignoreTrailingWhiteSpace | true, false | false | 是否跳过值后面的空格 | +| Both | nullValue | 任意字符 | “” | 声明文件中哪个字符表示空值 | +| Both | nanValue | 任意字符 | NaN | 声明哪个值表示NaN或者缺省值 | +| Both | positiveInf | 任意字符 | Inf | 正无穷 | +| Both | negativeInf | 任意字符 | -Inf | 负无穷 | +| Both | compression or codec | None,
uncompressed,
bzip2, deflate,
gzip, lz4, or
snappy | none | 文件压缩格式 | +| Both | dateFormat | 任何能转换为 Java的
SimpleDataFormat的字符串 | yyyy-MM-dd | 日期格式 | +| Both | timestampFormat | 任何能转换为 Java的
SimpleDataFormat的字符串 | yyyy-MMdd’T’HH:mm:ss.SSSZZ | 时间戳格式 | +| Read | maxColumns | 任意整数 | 20480 | 声明文件中的最大列数 | +| Read | maxCharsPerColumn | 任意整数 | 1000000 | 声明一个列中的最大字符数。 | +| Read | escapeQuotes | true, false | true | 是否应该转义行中的引号。 | +| Read | maxMalformedLogPerPartition | 任意整数 | 10 | 声明每个分区中最多允许多少条格式错误的数据，超过这个值后格式错误的数据将不会被读取 | +| Write | quoteAll | true, false | false | 指定是否应该将所有值都括在引号中，而不只是转义具有引号字符的值。 | +| Read | multiLine | true, false | false | 是否允许每条完整记录跨域多行 | + +### 9.2 JSON读写可选配置 + +| 读\写操作 | 配置项 | 可选值 | 默认值 | +| --------- | ---------------------------------- | ------------------------------------------------------------ | -------------------------------- | +| Both | compression or codec | None,
uncompressed,
bzip2, deflate,
gzip, lz4, or
snappy | none | +| Both | dateFormat | 任何能转换为 Java的 SimpleDataFormat的字符串 | yyyy-MM-dd | +| Both | timestampFormat | 任何能转换为 Java的 SimpleDataFormat的字符串 | yyyy-MMdd’T’HH:mm:ss.SSSZZ | +| Read | primitiveAsString | true, false | false | +| Read | allowComments | true, false | false | +| Read | allowUnquotedFieldNames | true, false | false | +| Read | allowSingleQuotes | true, false | true | +| Read | allowNumericLeadingZeros | true, false | false | +| Read | allowBackslashEscapingAnyCharacter | true, false | false | +| Read | columnNameOfCorruptRecord | true, false | Value of spark.sql.column&NameOf | +| Read | multiLine | true, false | false | + +### 9.3 数据库读写可选配置 + +| 属性名称 | 含义 | +| ------------------------------------------ | ------------------------------------------------------------ | +| url | 数据库地址 | +| dbtable | 表名称 | +| driver | 数据库驱动 | +| partitionColumn,
lowerBound, upperBoun | 分区总数，上界，下界 | +| numPartitions | 可用于表读写并行性的最大分区数。如果要写的分区数量超过这个限制，那么可以调用coalesce(numpartition)重置分区数。 | +| fetchsize | 每次往返要获取多少行数据。此选项仅适用于读取数据。 | +| batchsize | 每次往返插入多少行数据，这个选项只适用于写入数据。默认值是1000。 | +| isolationLevel | 事务隔离级别：可以是NONE，READ_COMMITTED, READ_UNCOMMITTED，REPEATABLE_READ或SERIALIZABLE，即标准事务隔离级别。
默认值是READ_UNCOMMITTED。这个选项只适用于数据读取。 | +| createTableOptions | 写入数据时自定义创建表的相关配置 | +| createTableColumnTypes | 写入数据时自定义创建列的列类型 | + +> 完整的配置可以参阅官方文档：https://spark.apache.org/docs/latest/sql-data-sources-jdbc.html + + + + + +## 参考资料 + +1. Matei Zaharia, Bill Chambers . Spark: The Definitive Guide[M] . 2018-02 + diff --git a/notes/SparkSQL数据源支持.md b/notes/SparkSQL数据源支持.md deleted file mode 100644 index fff2e24..0000000 --- a/notes/SparkSQL数据源支持.md +++ /dev/null @@ -1,14 +0,0 @@ -1.1 Json - -```scala -val empDF = spark.read.json("/usr/file/json/emp.json") -empDF.show() -``` - -1.2 - -```scala -val parquetFileDF = spark.read.parquet("/usr/file/parquet/emp.parquet") -parquetFileDF.show() -``` -