# 弹性式数据集RDDs ## 一、RDD简介 RDD,全称为 Resilient Distributed Datasets,是Spark最基本的数据抽象,它是只读的、分区记录的集合,支持并行操作。RDD可以由外部数据集或其他RDD转换而来。其具备高度的容错性,允许开发人员在大型集群上执行基于内存的并行计算。它具有以下特性: + 一个RDD由一个或者多个分区(Partitions)组成。对于RDD来说,每个分区会被一个计算任务所处理,用户可以在创建RDD时指定其分区个数,如果没有指定,则采用程序所分配到的CPU的核心数; + RDD拥有一个用于计算分区的函数compute; + RDD会保存彼此间的依赖关系,RDD的每次转换都会生成一个新的依赖关系,这种RDD之间的依赖关系就像流水线一样。在部分分区数据丢失后,可以通过这种依赖关系重新计算丢失的分区数据,而不是对RDD的所有分区进行重新计算; + Key-Value型的RDD还拥有Partitioner(分区器),用于决定数据被存储在哪个分区中,目前Spark中支持HashPartitioner(按照哈希分区)和RangeParationer(按照范围进行分区); + 一个优先位置列表(可选),用于存储每个分区的优先位置(prefered location)。对于一个HDFS文件来说,这个列表保存的就是每个分区所在的块的位置,按照“移动数据不如移动计算“的理念,Spark在进行任务调度的时候,会尽可能的将计算任务分配到其所要处理数据块的存储位置。 RDD[T]抽象类的部分相关代码如下: ```scala // 由子类实现以计算给定分区 def compute(split: Partition, context: TaskContext): Iterator[T] // 获取所有分区 protected def getPartitions: Array[Partition] // 获取所有依赖关系 protected def getDependencies: Seq[Dependency[_]] = deps // 获取优先位置列表 protected def getPreferredLocations(split: Partition): Seq[String] = Nil // 分区器 由子类重写以指定它们的分区方式 @transient val partitioner: Option[Partitioner] = None ``` ## 二、创建RDD RDD有两种创建方式,分别介绍如下: ### 2.1 由现有集合创建 这里使用`spark-shell`的本地模式作为测试,指定使用4个CPU 核心,启动命令如下: ```shell spark-shell --master local[4] ``` 启动`spark-shell`后,程序会自动创建应用上下文,相当于程序自动执行了下面的语句: ```scala val conf = new SparkConf().setAppName("Spark shell").setMaster("local[4]") val sc = new SparkContext(conf) ``` 由现有集合创建RDD,你可以在创建时指定其分区个数,如果没有指定,则采用程序所分配到的CPU的核心数: ```scala val data = Array(1, 2, 3, 4, 5) // 由现有集合创建RDD,默认分区数为程序所分配到的CPU的核心数 val dataRDD = sc.parallelize(data) // 查看分区数 dataRDD.getNumPartitions // 明确指定分区数 val dataRDD = sc.parallelize(data,2) ``` 执行结果如下:
### 2.2 引用外部存储系统中的数据集 引用外部存储系统中的数据集,例如共享文件系统,HDFS,HBase或支持Hadoop InputFormat的任何数据源。 ```scala val fileRDD = sc.textFile("/usr/file/emp.txt") // 获取第一行文本 fileRDD.take(1) ``` 使用外部存储系统有以下三点需要注意: + 支持本地文件系统,也支持HDFS,s3a等文件系统; + 如果Spark是以集群的方式运行,且需要从本地文件系统读取数据,则该文件必须在所有节点机器上都存在,且路径相同; + 文件格式支持目录,压缩文件,文件路径支持通配符。 ### 2.3 textFile & wholeTextFiles 两者都可以用来读取外部文件,但是返回格式是不同的: + textFile:其返回格式是RDD[String] ,返回的是就是文件内容,RDD中每一个元素对应一行数据; + wholeTextFiles:其返回格式是RDD[(String, String)],元组中第一个参数是文件路径,第二个参数是文件内容; + 两者都提供第二个参数来控制最小分区数; + 默认情况下,Spark为文件的每个块创建一个分区(HDFS中默认为128MB)。 ```scala def textFile(path: String,minPartitions: Int = defaultMinPartitions): RDD[String] = withScope {...} def wholeTextFiles(path: String,minPartitions: Int = defaultMinPartitions): RDD[(String, String)]={..} ``` ## 三、操作RDD RDD支持两种类型的操作:*transformations*(转换,从现有数据集创建新数据集)和*actions*(在数据集上运行计算后将值返回到驱动程序)。RDD中的所有转换操作都是惰性的,它们只是记住这些转换操作,但不会立即执行,只有遇到action操作后才会真正的进行计算,这类似于函数式编程中的惰性求值。 ```scala val list = List(1, 2, 3) // map 是一个transformations操作,而foreach是一个actions操作 sc.parallelize(list).map(_ * 10).foreach(println) // 输出: 10 20 30 ``` ## 四、缓存RDD ### 4.1 缓存级别 Spark速度非常快的一个原因是RDD支持缓存。当缓存一个RDD到内存中后,如果之后的操作使用到了该数据集,则从缓存获取。虽然缓存也有丢失的风险,但是由于RDD之间的依赖关系,如果某个分区的缓存数据丢失,只需要重新计算该分区即可。 Spark支持多种缓存级别,见下表: | Storage Level(存储级别) | Meaning(含义) | | ----------------------------------------------- | ------------------------------------------------------------ | | MEMORY_ONLY | 默认的缓存级别,将 RDD以反序列化的Java对象的形式存储在 JVM 中。如果内存空间不够,则部分分区数据将不再缓存。 | | MEMORY_AND_DISK | 将 RDD 以反序列化的Java对象的形式存储JVM中。如果内存空间不够,将未缓存的分区数据存储到磁盘,在需要使用这些分区时从磁盘读取。 | | MEMORY_ONLY_SER
(仅支持 Java and Scala) | 将 RDD 以序列化的Java对象的形式进行存储(每个分区为一个 byte 数组)。这种方式比反序列化对象节省存储空间,但在读取时会增加CPU的计算负担。 | | MEMORY_AND_DISK_SER
(仅支持 Java and Scala) | 类似于MEMORY_ONLY_SER,但是溢出的分区数据会存储到磁盘,而不是在用到它们时重新计算。 | | DISK_ONLY | 只在磁盘上缓存RDD | | MEMORY_ONLY_2,
MEMORY_AND_DISK_2, etc | 与上面的对应级别功能相同,但是会为每个分区在集群中两个节点上建立副本。 | | OFF_HEAP | 与MEMORY_ONLY_SER类似,但将数据存储在堆外内存中。这需要启用堆外内存。 | > 启动堆外内存需要配置两个参数: > > + spark.memory.offHeap.enabled :是否开启堆外内存,默认值为false,需要设置为true; > + spark.memory.offHeap.size : 堆外内存空间的大小,默认值为0,需要设置为正值。 ### 4.2 使用缓存 RDD上有两个可选的方法用于缓存数据:`persist`和`cache` ,cache内部调用的也是persist,其等价于`persist(StorageLevel.MEMORY_ONLY)`。 ```scala // 所有存储级别均定义在StorageLevel对象中 fileRDD.persist(StorageLevel.MEMORY_AND_DISK) fileRDD.cache() ``` ### 4.3 移除缓存 Spark会自动监视每个节点上的缓存使用情况,并按照最近最少使用(LRU)的规则删除旧数据分区。当然,你也可以使用`RDD.unpersist()`方法进行手动删除。 ## 五、理解shuffle ### 5.1 shuffle介绍 Spark中,一个任务对应一个分区,通常不会跨分区操作数据。但如果遇到reduceByKey等操作,Spark必须从所有分区读取数据,并查找所有键的所有值,然后汇总在一起以计算每个键的最终结果 ,这称为shuffle。
### 5.2 Shuffle的影响 Shuffle是一项昂贵的操作,因为它通常会跨节点操作数据,这必然会涉及磁盘I/O,网络I/O,和数据序列化。某些shuffle操作还会消耗大量的堆内存,因为它们使用内存中的数据结构来组织数据并传输。Shuffle还会在磁盘上生成大量中间文件,从Spark 1.3开始,这些文件将被保留,直到相应的RDD不再使用并进行垃圾回收,这样做是为了避免在计算时重复创建shuffle文件。如果应用程序长期保留对这些RDD的引用,则垃圾回收可能在很长一段时间后才会发生,这意味着长时间运行的Spark作业可能会占用大量磁盘空间,通常可以使用`spark.local.dir`参数指定这些文件临时存储目录。 ### 5.3 导致Shuffle的操作 由于Shuffle操作对性能的影响比较大,所以需要特别注意使用,以下操作都会导致Shuffle: + 涉及到重新分区操作: 如`repartition` 和 `coalesce`; + 所有涉及到ByKey的操作(counting除外):如`groupByKey`和`reduceByKey`; + 联结操作:如`cogroup`和`join`。 ## 五、宽依赖和窄依赖 RDD和它的父RDD(s)之间的依赖关系分为两种不同的类型: - 窄依赖(narrow dependency):父RDDs的一个分区最多被子RDDs一个分区所依赖; - 宽依赖(wide dependency):父RDDs的一个分区可以被子RDDs的多个子分区所依赖。 如下图:每一个方框表示一个 RDD,带有颜色的矩形表示分区
区分这两种依赖是非常有用的: + 首先,窄依赖允许在一个集群节点上以流水线的方式(pipeline)对父分区数据进行计算。例如,先执行map操作、然后执行filter操作;而宽依赖则需要首先计算好所有父分区的数据,然后在节点之间进行Shuffle,这与MapReduce类似。 + 窄依赖能够更有效地进行数据恢复,因为只需重新对丢失分区的父分区进行计算,且不同节点之间可以并行计算;而对于宽依赖而言,如果数据丢失,则需要对所有父分区数据进行计算并Shuffle。 ## 六、DAG的生成 RDD(s)及其之间的依赖关系组成了DAG(有向无环图),DAG定义了这些RDD(s)之间的Lineage(血统)关系,通过血统关系,如果一个RDD的部分或者全部计算结果丢失了,也可以重新进行计算。 那么Spark是如何根据DAG来生成计算任务呢?主要是根据依赖关系的不同将DAG划分为不同的计算阶段(Stage): + 对于窄依赖,由于分区的依赖关系是确定的,其转换操作可以在同一个线程执行,所以可以划分到同一个执行阶段; + 对于宽依赖,由于Shuffle的存在,只能在父RDD(s)被Shuffle处理完成后,才能开始接下来的计算,因此遇到宽依赖就需要重新划分阶段。
## 参考资料 1. 张安站 . Spark技术内幕:深入解析Spark内核架构设计与实现原理[M] . 机械工业出版社 . 2015-09-01 2. [RDD Programming Guide](https://spark.apache.org/docs/latest/rdd-programming-guide.html#rdd-programming-guide) 3. [RDD:基于内存的集群计算容错抽象](http://shiyanjun.cn/archives/744.html)