# Spark SQL 外部数据源 ## 一、简介 ### 1.1 多数据源支持 Spark支持以下六个核心数据源,同时Spark社区还提供了多达上百种数据源的读取方式,能够满足绝大部分使用场景。 - CSV - JSON - Parquet - ORC - JDBC/ODBC connections - Plain-text files ### 1.2 读数据格式 所有数据源读取API都遵循以下调用格式: ```scala // 格式 DataFrameReader.format(...).option("key", "value").schema(...).load() // 示例 spark.read.format("csv") .option("mode", "FAILFAST") // 读取模式 .option("inferSchema", "true") // 是否自动推断schema .option("path", "path/to/file(s)") // 文件路径 .schema(someSchema) // 使用预定义的schema .load() ``` 读取模式有以下三种可选项: | 读模式 | 描述 | | --------------- | ------------------------------------------------------------ | | `permissive` | 当遇到损坏的记录时,将其所有字段设置为null,并将所有损坏的记录放在名为_corruption t_record的字符串列中 | | `dropMalformed` | 删除格式不正确的行 | | `failFast` | 遇到格式不正确的数据时立即失败 | ### 1.3 写数据格式 ```scala // 格式 DataFrameWriter.format(...).option(...).partitionBy(...).bucketBy(...).sortBy( ...).save() //示例 dataframe.write.format("csv") .option("mode", "OVERWRITE") //写模式 .option("dateFormat", "yyyy-MM-dd") .option("path", "path/to/file(s)") .save() ``` | Scala/Java | 描述 | | :--------------------------------- | :----------------------------------------------------------- | | `SaveMode.ErrorIfExists`(默认模式) | 如果给定的路径已经存在文件,则抛出异常,这是写数据默认的模式 | | `SaveMode.Append` | 数据以追加的方式写入 | | `SaveMode.Overwrite` | 数据以覆盖的方式写入 | | `SaveMode.Ignore` | Ignore mode means that when saving a DataFrame to a data source, if data already exists, the save operation is expected not to save the contents of the DataFrame and not to change the existing data. This is similar to a `CREATE TABLE IF NOT EXISTS` in SQL. | ## 二、CSV CSV是一种常见的文本文件格式,其中每一行表示一条记录,记录中的每个字段用逗号分隔。 ### 2.1 读取CSV文件 自动推断类型: ```scala spark.read.format("csv") .option("header", "true") .option("mode", "FAILFAST") .option("inferSchema", "true") .load("some/path/to/file.csv") ``` 使用预定义类型: ```scala import org.apache.spark.sql.types.{StructField, StructType, StringType, LongType} val myManualSchema = new StructType(Array( new StructField("DEST_COUNTRY_NAME", StringType, true), new StructField("ORIGIN_COUNTRY_NAME", StringType, true), new StructField("count", LongType, false) )) spark.read.format("csv") .option("header", "true") .option("mode", "FAILFAST") .schema(myManualSchema) .load("/data/flight-data/csv/2010-summary.csv") .show(5) ``` ### 2.2 写入CSV文件 ```scala import org.apache.spark.sql.types.{StructField, StructType, StringType, LongType} val myManualSchema = new StructType(Array( new StructField("DEST_COUNTRY_NAME", StringType, true), new StructField("ORIGIN_COUNTRY_NAME", StringType, true), new StructField("count", LongType, false) )) spark.read.format("csv") .option("header", "true") .option("mode", "FAILFAST") .schema(myManualSchema) .load("/data/flight-data/csv/2010-summary.csv") .show(5) ``` 将csv文件,转换为tsv文件: ```scala csvFile.write.format("csv").mode("overwrite").option("sep", "\t") .save("/tmp/my-tsv-file.tsv") ``` ## 三、JSON ### 3.1 读取JSON文件 ```json spark.read.format("json").option("mode", "FAILFAST").schema(myManualSchema) .load("/data/flight-data/json/2010-summary.json").show(5) ``` ### 3.2 写入JSON文件 ```scala csvFile.write.format("json").mode("overwrite").save("/tmp/my-json-file.json") ``` ## 四、Parquet Parquet是一个开源的面向列的数据存储,它提供了多种存储优化,允许读取单独的列非整个文件,这不仅节省了存储空间而且提升了读取效率,它是Spark是默认的文件格式。 ### 4.1 读取Parquet文件 ```scala spark.read.format("parquet") .load("/data/flight-data/parquet/2010-summary.parquet").show(5) ``` 需要注意的是:默认不支持一条数据记录跨越多行,可以通过配置`multiLine`为`true`来进行更改,其默认值为`false`。 ### 2.2 写入Parquet文件 ```scala csvFile.write.format("parquet").mode("overwrite") .save("/tmp/my-parquet-file.parquet") ``` ### 2.3 可选配置 Parquet文件有着自己的存储规则,因此其可选配置项比较少,常用的有如下两个: | 读写操作 | 配置项 | 可选值 | 默认值 | 描述 | | -------- | -------------------- | ------------------------------------------------------------ | ------------------------------------------- | ------------------------------------------------------------ | | 读 | compression or codec | None,
uncompressed,
bzip2,
deflate, gzip,
lz4, or snappy | None | 压缩文件格式 | | Read | mergeSchema | true, false | 取决于配置项`spark.sql.parquet.mergeSchema` | 当为真时,Parquet数据源将从所有数据文件收集的Schema合并在一起,否则将从摘要文件中选择Schema,如果没有可用的摘要文件,则从随机数据文件中选择Schema。 | > 完整的配置列表可以参阅官方文档:https://spark.apache.org/docs/latest/sql-data-sources-parquet.html ## 五、ORC ORC是一种自描述的、类型感知的列文件格式,它针对大型数据的读取进行了优化,也是大数据中常用的文件格式。 ### 5.1 读取ORC文件 ```scala spark.read.format("orc").load("/data/flight-data/orc/2010-summary.orc").show(5) ``` ### 4.2 写入ORC文件 ```scala csvFile.write.format("orc").mode("overwrite").save("/tmp/my-json-file.orc") ``` ## 六、SQL Databases spark同样支持与传统的关系型数据库进行数据读写。 ### 6.1 获取数据库连接 ```scala import java.sql.DriverManager val connection = DriverManager.getConnection(url) connection.isClosed() connection.close() ``` ### 6.2 读取数据 读取全表数据: ```scala val pgDF = spark.read .format("jdbc") .option("driver", "org.postgresql.Driver") .option("url", "jdbc:postgresql://database_server") .option("dbtable", "schema.tablename") .option("user", "username").option("password","my-secret-password").load() ``` 读取过滤后的数据: ```scala val pushdownQuery = """(SELECT DISTINCT(DEST_COUNTRY_NAME) FROM flight_info) AS flight_info""" val dbDataFrame = spark.read.format("jdbc") .option("url", url).option("dbtable", pushdownQuery).option("driver", driver) .load() ``` ```scala val props = new java.util.Properties props.setProperty("driver", "org.sqlite.JDBC") val predicates = Array( "DEST_COUNTRY_NAME != 'Sweden' OR ORIGIN_COUNTRY_NAME != 'Sweden'", "DEST_COUNTRY_NAME != 'Anguilla' OR ORIGIN_COUNTRY_NAME != 'Anguilla'") spark.read.jdbc(url, tablename, predicates, props).count() // 510 ``` 并行读取数据: ```scala val dbDataFrame = spark.read.format("jdbc") .option("url", url).option("dbtable", tablename).option("driver", driver) .option("numPartitions", 10).load() ``` 在这里,我们对第一个分区和最后一个分区分别指定了最小值和最大值。任何超出这些界限的都在第一个分区或最后一个分区中。然后,我们设置希望的分区总数(这是并行度的级别)。 ```scala val colName = "count" val lowerBound = 0L val upperBound = 348113L // this is the max count in our database val numPartitions = 10 spark.read.jdbc(url,tablename,colName,lowerBound,upperBound,numPartitions,props) .count() // 255 ``` ### 6.3 写入数据 ```scala val newPath = "jdbc:sqlite://tmp/my-sqlite.db" csvFile.write.mode("overwrite").jdbc(newPath, tablename, props) ``` ## 七、Text ### 7.1 读取Text数据 ```scala spark.read.textFile("/data/flight-data/csv/2010-summary.csv") .selectExpr("split(value, ',') as rows").show() ``` ### 7.2 写入Text数据 ```scala csvFile.select("DEST_COUNTRY_NAME").write.text("/tmp/simple-text-file.txt") ``` ## 八、数据读写高级概念 ### 8.1 并行读 多个executors不能同时读取同一个文件,但它们可以同时读取不同的文件。一般来说,这意味着当您从一个包含多个文件的文件夹中读取数据时,这些文件中的每一个都将成为DataFrame中的一个分区,并由可用的executors并行读取。 ### 8.2 并行写 写入的文件或数据的数量取决于写入数据时DataFrame拥有的分区数量。默认情况下,每个数据分区写一个文件。 ### 8.3 分区写入 ```scala csvFile.limit(10).write.mode("overwrite").partitionBy("DEST_COUNTRY_NAME") .save("/tmp/partitioned-files.parquet") ``` ### 8.3 分桶写入 ```scala val numberBuckets = 10 val columnToBucketBy = "count" csvFile.write.format("parquet").mode("overwrite").bucketBy(numberBuckets, columnToBucketBy).saveAsTable("bucketedFiles") ``` ### 8.5 文件大小管理 如果写入产生大量小文件,这时会产生大量的元数据开销。Spark和HDFS一样,都不能很好的处理这个问题,这被称为“small file problem”。同时数据文件也不能过大,否则在查询时会有不必要的性能开销,因此要把文件大小控制在一个合理的范围内。 在上文我们已经介绍过可以通过分区数量来控制生成文件的数量,从而间接控制文件大小。Spark 2.2引入了一种新的方法,以更自动化的方式控制文件大小,这就是`maxRecordsPerFile`参数,它允许你通过控制写入文件的记录数来控制文件大小。 ```scala // Spark将确保文件最多包含5000条记录 df.write.option(“maxRecordsPerFile”, 5000) ``` ## 九、附录 ### 9.1 CSV读写可选配置 | 读\写操作 | 配置项 | 可选值 | 默认值 | 描述 | | --------- | --------------------------- | ------------------------------------------------------------ | -------------------------- | ------------------------------------------------------------ | | Both | seq | 任意字符 | `,`(逗号) | 分隔符 | | Both | header | true, false | false | 文件中的第一行是否为列的名称。 | | Read | escape | 任意字符 | \ | 转义字符 | | Read | inferSchema | true, false | false | 是否自动推断列类型 | | Read | ignoreLeadingWhiteSpace | true, false | false | 是否跳过值前面的空格 | | Both | ignoreTrailingWhiteSpace | true, false | false | 是否跳过值后面的空格 | | Both | nullValue | 任意字符 | “” | 声明文件中哪个字符表示空值 | | Both | nanValue | 任意字符 | NaN | 声明哪个值表示NaN或者缺省值 | | Both | positiveInf | 任意字符 | Inf | 正无穷 | | Both | negativeInf | 任意字符 | -Inf | 负无穷 | | Both | compression or codec | None,
uncompressed,
bzip2, deflate,
gzip, lz4, or
snappy | none | 文件压缩格式 | | Both | dateFormat | 任何能转换为 Java的
SimpleDataFormat的字符串 | yyyy-MM-dd | 日期格式 | | Both | timestampFormat | 任何能转换为 Java的
SimpleDataFormat的字符串 | yyyy-MMdd’T’HH:mm:ss.SSSZZ | 时间戳格式 | | Read | maxColumns | 任意整数 | 20480 | 声明文件中的最大列数 | | Read | maxCharsPerColumn | 任意整数 | 1000000 | 声明一个列中的最大字符数。 | | Read | escapeQuotes | true, false | true | 是否应该转义行中的引号。 | | Read | maxMalformedLogPerPartition | 任意整数 | 10 | 声明每个分区中最多允许多少条格式错误的数据,超过这个值后格式错误的数据将不会被读取 | | Write | quoteAll | true, false | false | 指定是否应该将所有值都括在引号中,而不只是转义具有引号字符的值。 | | Read | multiLine | true, false | false | 是否允许每条完整记录跨域多行 | ### 9.2 JSON读写可选配置 | 读\写操作 | 配置项 | 可选值 | 默认值 | | --------- | ---------------------------------- | ------------------------------------------------------------ | -------------------------------- | | Both | compression or codec | None,
uncompressed,
bzip2, deflate,
gzip, lz4, or
snappy | none | | Both | dateFormat | 任何能转换为 Java的 SimpleDataFormat的字符串 | yyyy-MM-dd | | Both | timestampFormat | 任何能转换为 Java的 SimpleDataFormat的字符串 | yyyy-MMdd’T’HH:mm:ss.SSSZZ | | Read | primitiveAsString | true, false | false | | Read | allowComments | true, false | false | | Read | allowUnquotedFieldNames | true, false | false | | Read | allowSingleQuotes | true, false | true | | Read | allowNumericLeadingZeros | true, false | false | | Read | allowBackslashEscapingAnyCharacter | true, false | false | | Read | columnNameOfCorruptRecord | true, false | Value of spark.sql.column&NameOf | | Read | multiLine | true, false | false | ### 9.3 数据库读写可选配置 | 属性名称 | 含义 | | ------------------------------------------ | ------------------------------------------------------------ | | url | 数据库地址 | | dbtable | 表名称 | | driver | 数据库驱动 | | partitionColumn,
lowerBound, upperBoun | 分区总数,上界,下界 | | numPartitions | 可用于表读写并行性的最大分区数。如果要写的分区数量超过这个限制,那么可以调用coalesce(numpartition)重置分区数。 | | fetchsize | 每次往返要获取多少行数据。此选项仅适用于读取数据。 | | batchsize | 每次往返插入多少行数据,这个选项只适用于写入数据。默认值是1000。 | | isolationLevel | 事务隔离级别:可以是NONE,READ_COMMITTED, READ_UNCOMMITTED,REPEATABLE_READ或SERIALIZABLE,即标准事务隔离级别。
默认值是READ_UNCOMMITTED。这个选项只适用于数据读取。 | | createTableOptions | 写入数据时自定义创建表的相关配置 | | createTableColumnTypes | 写入数据时自定义创建列的列类型 | > 完整的配置可以参阅官方文档:https://spark.apache.org/docs/latest/sql-data-sources-jdbc.html ## 参考资料 1. Matei Zaharia, Bill Chambers . Spark: The Definitive Guide[M] . 2018-02