learn-tech/专栏/陈天·Rust编程第一课/32实操项目:使用PyO3开发Python3模块.md
2024-10-16 11:12:24 +08:00

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                        32 实操项目使用PyO3开发Python3模块
                        你好,我是陈天。

上一讲介绍了 FFI 的基本用法,今天我们就趁热打铁来做个实操项目,体验一下如何把 Rust 生态中优秀的库介绍到 Python/Node.js 的社区。

由于社区里已经有 PyO3 和 Neon 这样的工具,我们并不需要处理 Rust 代码兼容 C ABI 的细节,这些工具就可以直接处理。所以,今天会主要撰写 FFI shim 这一层的代码:-

另外PyO3和Neon的基本操作都是一样的你会用一个另一个的使用也就很容易理解了。这一讲我们就以 PyO3 为例。

那么,做个什么库提供给 Python 呢?

思来想去,我觉得 Python 社区里可以内嵌在程序中的搜索引擎,目前还是一块短板。我所知道的 whoosh 已经好多年没有更新了pylucene 需要在 Python 里运行个 JVM总是让人有种说不出的不舒服。虽然 Node.js 的 flexsearch 看上去还不错(我没有用过),但整体来说,这两个社区都需要有更强大的搜索引擎。

Rust 下,嵌入式的搜索引擎有 tantivy我们就使用它来提供搜索引擎的功能。

不过tanvity 的接口比较复杂,今天的主题也不是学习如何使用一个搜索引擎的接口,所以我做了基于 tanvity 的 crate xunmi提供一套非常简单的接口今天我们的目标就是为这些接口提供对应的 Python 接口,并且让使用起来的感觉和 Python 一致。

下面是 xunmi 用 Rust 调用的例子:

use std::{str::FromStr, thread, time::Duration}; use xunmi::*;

fn main() { // 可以通过 yaml 格式的配置文件加载定义好的 schema let config = IndexConfig::from_str(include_str!("../fixtures/config.yml")).unwrap();

// 打开或者创建 index
let indexer = Indexer::open_or_create(config).unwrap();

// 要 index 的数据,可以是 xml/yaml/json
let content = include_str!("../fixtures/wiki_00.xml");

// 我们使用的 wikipedia dump 是 xml 格式的,所以 InputType::Xml
// 这里wikipedia 的数据结构 id 是字符串,但 index 的 schema 里是 u64
// wikipedia 里没有 content 字段,节点的内容($value相当于 content
// 所以我们需要对数据定义一些格式转换
let config = InputConfig::new(
    InputType::Xml,
    vec![("$value".into(), "content".into())],
    vec![("id".into(), (ValueType::String, ValueType::Number))],
);

// 获得 index 的 updater用于更新 index
let mut updater = indexer.get_updater();
// 你可以使用多个 updater 在不同上下文更新同一个 index
let mut updater1 = indexer.get_updater();

// 可以通过 add/update 来更新 indexadd 直接添加update 会删除已有的 doc
// 然后添加新的
updater.update(content, &config).unwrap();
// 你可以添加多组数据,最后统一 commit
updater.commit().unwrap();

// 在其他上下文下更新 index
thread::spawn(move || {
    let config = InputConfig::new(InputType::Yaml, vec![], vec![]);
    let text = include_str!("../fixtures/test.yml");

    updater1.update(text, &config).unwrap();
    updater1.commit().unwrap();
});

// indexer 默认会自动在每次 commit 后重新加载,但这会有上百毫秒的延迟
// 在这个例子里我们会等一段时间再查询
while indexer.num_docs() == 0 {
    thread::sleep(Duration::from_millis(100));
}

println!("total: {}", indexer.num_docs());

// 你可以提供查询来获取搜索结果
let result = indexer.search("历史", &["title", "content"], 5, 0).unwrap();
for (score, doc) in result.iter() {
    // 因为 schema 里 content 只索引不存储,所以输出里没有 content
    println!("score: {}, doc: {:?}", score, doc);
}

}

以下是索引的配置文件的样子:


path: /tmp/searcher_index # 索引路径 schema: # 索引的 schema对于文本使用 CANG_JIE 做中文分词

  • name: id type: u64 options: indexed: true fast: single stored: true
  • name: url type: text options: indexing: ~ stored: true
  • name: title type: text options: indexing: record: position tokenizer: CANG_JIE stored: true
  • name: content type: text options: indexing: record: position tokenizer: CANG_JIE stored: false # 对于 content我们只索引不存储 text_lang: chinese: true # 如果是 true自动做繁体到简体的转换 writer_memory: 100000000

目标是,使用 PyO3 让 Rust 代码可以这样在 Python 中使用:-

好,废话不多说,我们开始今天的项目挑战。

首先 cargo new xunmi-py --lib 创建一个新的项目,在 Cargo.toml 中添入:

[package] name = "xunmi-py" version = "0.1.0" edition = "2021"

[lib] name = "xunmi" crate-type = ["cdylib"]

[dependencies] pyo3 = {version = "0.14", features = ["extension-module"]} serde_json = "1" xunmi = "0.2"

[build-dependencies] pyo3-build-config = "0.14"

要定义好 lib 的名字和类型。lib 的名字,我们就定义成 xunmi这样在 Python 中 import 时就用这个名称crate-type 是 cdylib我们需要 pyo3-build-config 这个 crate 来做编译时的一些简单处理macOS 需要)。

准备工作

接下来在写代码之前,还要做一些准备工作,主要是 build 脚本和 Makefile让我们能方便地生成 Python 库。

创建 build.rs并添入

fn main() { println!("cargo:rerun-if-changed=build.rs"); pyo3_build_config::add_extension_module_link_args(); }

它会在编译的时候添加一些编译选项。如果你不想用 build.rs 来额外处理,也可以创建 .cargo/config然后添加

[target.x86_64-apple-darwin] rustflags = [ "-C", "link-arg=-undefined", "-C", "link-arg=dynamic_lookup", ]

二者的作用是等价的。

然后我们创建一个目录 xunmi再创建 xunmi/init.py添入

from .xunmi import *

最后创建一个 Makefile添入

如果你的 BUILD_DIR 不同,可以 make BUILD_DIR=

BUILD_DIR := target/release

SRCS := $(wildcard src/*.rs) Cargo.toml NAME = xunmi TARGET = lib$(NAME) BUILD_FILE = $(BUILD_DIR)/$(TARGET).dylib BUILD_FILE1 = $(BUILD_DIR)/$(TARGET).so TARGET_FILE = $(NAME)/$(NAME).so

all: $(TARGET_FILE)

test: $(TARGET_FILE) python3 -m pytest

$(TARGET_FILE): $(BUILD_FILE1) @cp $(BUILD_FILE1) $(TARGET_FILE)

$(BUILD_FILE1): $(SRCS) @cargo build --release @mv $(BUILD_FILE) $(BUILD_FILE1)|| true

PHONY: test all

这个 Makefile 可以帮我们自动化一些工作,基本上,就是把编译出来的 .dylib 或者 .so 拷贝到 xunmi 目录下,被 python 使用。

撰写代码

接下来就是如何撰写 FFI shim 代码了。PyO3 为我们提供了一系列宏,可以很方便地把 Rust 的数据结构、函数、数据结构的方法,以及错误类型,映射成 Python 的类、函数、类的方法,以及异常。我们来一个个看。

将 Rust struct 注册为 Python class

之前在[第 6 讲],我们简单介绍了函数是如何被引入到 pymodule 中的:

use pyo3::{exceptions, prelude::*};

#[pyfunction] pub fn example_sql() -> PyResult { Ok(queryer::example_sql()) }

#[pyfunction] pub fn query(sql: &str, output: Option<&str>) -> PyResult { let rt = tokio::runtime::Runtime::new().unwrap(); let data = rt.block_on(async { queryer::query(sql).await.unwrap() }); match output { Some("csv") | None => Ok(data.to_csv().unwrap()), Some(v) => Err(exceptions::PyTypeError::new_err(format!( "Output type {} not supported", v ))), } }

#[pymodule] fn queryer_py(_py: Python, m: &PyModule) -> PyResult<()> { m.add_function(wrap_pyfunction!(query, m)?)?; m.add_function(wrap_pyfunction!(example_sql, m)?)?; Ok(()) }

使用了 #[pymodule] 宏,来提供 python module 入口函数,它负责注册这个 module 下的类和函数。通过 m.add_function 可以注册函数,之后,在 Python 里就可以这么调用:

import queryer_py queryer_py.query("select * from file:///test.csv")

但当时我们想暴露出来的接口功能很简单,让用户传入一个 SQL 字符串和输出类型的字符串,返回一个按照 SQL 查询处理过的、符合输出类型的字符串。所以为 Python 模块提供了两个接口 example_sql 和 query。

不过,我们今天要做的事情远比第 6 讲中对 PyO3 的使用复杂。比如说要在两门语言中传递数据结构,让 Python 类可以使用 Rust 方法等,所以需要注册一些类以及对应的类方法。

看上文使用截图中的一些代码(复制到这里了):

from xunmi import *

indexer = Indexer("./fixtures/config.yml") updater = indexer.get_updater() f = open("./fixtures/wiki_00.xml") data = f.read() f.close() input_config = InputConfig("xml", [("$value", "content")], [("id", ("string", "number"))]) updater.update(data, input_config) updater.commit()

result = indexer.search("历史", ["title", "content"], 5, 0)

你会发现,我们需要注册 Indexer、IndexUpdater 和 InputConfig 这三个类它们都有自己的成员函数其中Indexer 和 InputConfig 还要有类的构造函数。

但是因为 xunmi 是 xunmi-py 外部引入的一个 crate我们无法直接动 xunmi 的数据结构,把这几个类注册进去。怎么办?我们需要封装一下:

use pyo3::{exceptions, prelude::*}; use xunmi::{self as x};

#[pyclass] pub struct Indexer(x::Indexer);

#[pyclass] pub struct InputConfig(x::InputConfig);

#[pyclass] pub struct IndexUpdater(x::IndexUpdater);

这里有个小技巧,可以把 xunmi 的命名空间临时改成 x这样xunmi 自己的结构用 x:: 来引用,就不会有命名的冲突了。

有了这三个定义,我们就可以通过 m.add_class 把它们引入到模块中:

#[pymodule] fn xunmi(_py: Python, m: &PyModule) -> PyResult<()> { m.add_class::()?; m.add_class::()?; m.add_class::()?; Ok(()) }

注意,这里的函数名要和 crate lib name 一致,如果你没有定义 lib name默认会使用 crate name。我们为了区别crate name 使用了 “xunmi-py”所以前面在 Cargo.toml 里,会单独声明一下 lib name

[lib] name = "xunmi" crate-type = ["cdylib"]

把 struct 的方法暴露成 class 的方法

注册好Python的类继续写功能的实现基本上是 shim 代码,也就是把 xunmi 里对应的数据结构的方法暴露给 Python。先看个简单的IndexUpdater 的实现:

#[pymethods] impl IndexUpdater { pub fn add(&mut self, input: &str, config: &InputConfig) -> PyResult<()> { Ok(self.0.add(input, &config.0).map_err(to_pyerr)?) }

pub fn update(&mut self, input: &str, config: &InputConfig) -> PyResult<()> {
    Ok(self.0.update(input, &config.0).map_err(to_pyerr)?)
}

pub fn commit(&mut self) -> PyResult<()> {
    Ok(self.0.commit().map_err(to_pyerr)?)
}

pub fn clear(&self) -> PyResult<()> {
    Ok(self.0.clear().map_err(to_pyerr)?)
}

}

首先,需要用 #[pymethods] 来包裹 impl IndexUpdater {},这样,里面所有的 pub 方法都可以在 Python 侧使用。我们暴露了 add/update/commit/clear 这几个方法。方法的类型签名正常撰写即可Rust 的基本类型都能通过 PyO3 对应到 Python使用到的 InputConfig 之前也注册成 Python class 了。

所以,通过这些方法,一个 Python 用户就可以轻松地在 Python 侧生成字符串,生成 InputConfig 类,然后传给 update() 函数,交给 Rust 侧处理。比如这样:

f = open("./fixtures/wiki_00.xml") data = f.read() f.close() input_config = InputConfig("xml", [("$value", "content")], [("id", ("string", "number"))]) updater.update(data, input_config)

错误处理

还记得上一讲强调的三个要点吗在写FFI的时候要注意Rust的错误处理。这里所有函数如果要返回 Result需要使用 PyResult。你原本的错误类型需要处理一下变成 Python 错误。

我们可以用 map_err 处理,其中 to_pyerr 实现如下:

pub(crate) fn to_pyerr<E: ToString>(err: E) -> PyErr { exceptions::PyValueError::new_err(err.to_string()) }

通过使用 PyO3 提供的 PyValueError在 Rust 侧生成的 err会被 PyO3 转化成 Python 侧的异常。比如我们在创建 indexer 时提供一个不存在的 config

In [3]: indexer = Indexer("./fixtures/config.ymla")

ValueError Traceback (most recent call last) in ----> 1 indexer = Indexer("./fixtures/config.ymla")

ValueError: No such file or directory (os error 2)

即使你在 Rust 侧使用了 panic!PyO3 也有很好的处理:

In [3]: indexer = Indexer("./fixtures/config.ymla")

PanicException Traceback (most recent call last) in ----> 1 indexer = Indexer("./fixtures/config.ymla") 2 updater = indexer.get_updater()

PanicException: called Result::unwrap() on an Err value: Os { code: 2, kind: NotFound, message: "No such file or directory" }

它也是在 Python 侧抛出一个异常。

构造函数

好,接着看 Indexer 怎么实现:

#[pymethods] impl Indexer { // 创建或载入 index #[new] pub fn open_or_create(filename: &str) -> PyResult { let content = fs::read_to_string(filename).unwrap(); let config = x::IndexConfig::from_str(&content).map_err(to_pyerr)?; let indexer = x::Indexer::open_or_create(config).map_err(to_pyerr)?; Ok(Indexer(indexer)) }

// 获取 updater
pub fn get_updater(&self) -> IndexUpdater {
    IndexUpdater(self.0.get_updater())
}

// 搜索
pub fn search(
    &self,
    query: String,
    fields: Vec<String>,
    limit: usize,
    offset: Option<usize>,
) -> PyResult<Vec<(f32, String)>> {
    let default_fields: Vec<_> = fields.iter().map(|s| s.as_str()).collect();
    let data: Vec<_> = self
        .0
        .search(&query, &default_fields, limit, offset.unwrap_or(0))
        .map_err(to_pyerr)?
        .into_iter()
        .map(|(score, doc)| (score, serde_json::to_string(&doc).unwrap()))
        .collect();

    Ok(data)
}

// 重新加载 index
pub fn reload(&self) -> PyResult<()> {
    self.0.reload().map_err(to_pyerr)
}

}

你看,我们可以用 #[new] 来标记要成为构造函数的方法,所以,在 Python 侧,当你调用:

indexer = Indexer("./fixtures/config.yml")

其实,它在 Rust 侧就调用了 open_or_crate 方法。把某个用来构建数据结构的方法,标记为一个构造函数,可以让 Python 用户感觉用起来更加自然。

缺省参数

最后来看看缺省参数的实现。Python 支持缺省参数,但 Rust 不支持缺省参数,怎么破?

别着急PyO3 巧妙使用了 Option当 Python 侧使用缺省参数时,相当于传给 Rust 一个 NoneRust 侧就可以根据 None 来使用缺省值,比如下面 InputConfig 的实现:

#[pymethods] impl InputConfig { #[new] fn new( input_type: String, mapping: Option<Vec<(String, String)>>, conversion: Option<Vec<(String, (String, String))>>, ) -> PyResult { let input_type = match input_type.as_ref() { "yaml" | "yml" => x::InputType::Yaml, "json" => x::InputType::Json, "xml" => x::InputType::Xml, _ => return Err(exceptions::PyValueError::new_err("Invalid input type")), }; let conversion = conversion .unwrap_or_default() .into_iter() .filter_map(|(k, (t1, t2))| { let t = match (t1.as_ref(), t2.as_ref()) { ("string", "number") => (x::ValueType::String, x::ValueType::Number), ("number", "string") => (x::ValueType::Number, x::ValueType::String), _ => return None, }; Some((k, t)) }) .collect::<Vec<_>>();

    Ok(Self(x::InputConfig::new(
        input_type,
        mapping.unwrap_or_default(),
        conversion,
    )))
}

}

这段代码是典型的 shim 代码,它就是把接口包装成更简单的形式提供给 Python然后内部做转换适配原本的接口。

在 Python 侧,当 mapping 或 conversion 不需要时,可以不提供。这里我们使用 unwrap_or_default() 来得到缺省值(对 Vec 来说就是 vec![])。这样,在 Python 侧这么调用都是合法的:

input_config = InputConfig("xml", [("$value", "content")], [("id", ("string", "number"))]) input_config = InputConfig("xml", [("$value", "content")]) input_config = InputConfig("xml")

完整代码

好了,到这里今天的主要目标就基本完成啦。 xunmi-py 里 src/lib.rs 的完整代码也展示一下供你对比参考:

use pyo3::{ exceptions, prelude::*, types::{PyDict, PyTuple}, }; use std::{fs, str::FromStr}; use xunmi::{self as x};

pub(crate) fn to_pyerr<E: ToString>(err: E) -> PyErr { exceptions::PyValueError::new_err(err.to_string()) }

#[pyclass] pub struct Indexer(x::Indexer);

#[pyclass] pub struct InputConfig(x::InputConfig);

#[pyclass] pub struct IndexUpdater(x::IndexUpdater);

#[pymethods] impl Indexer { #[new] pub fn open_or_create(filename: &str) -> PyResult { let content = fs::read_to_string(filename).map_err(to_pyerr)?; let config = x::IndexConfig::from_str(&content).map_err(to_pyerr)?; let indexer = x::Indexer::open_or_create(config).map_err(to_pyerr)?; Ok(Indexer(indexer)) }

pub fn get_updater(&self) -> IndexUpdater {
    IndexUpdater(self.0.get_updater())
}

pub fn search(
    &self,
    query: String,
    fields: Vec<String>,
    limit: usize,
    offset: Option<usize>,
) -> PyResult<Vec<(f32, String)>> {
    let default_fields: Vec<_> = fields.iter().map(|s| s.as_str()).collect();
    let data: Vec<_> = self
        .0
        .search(&query, &default_fields, limit, offset.unwrap_or(0))
        .map_err(to_pyerr)?
        .into_iter()
        .map(|(score, doc)| (score, serde_json::to_string(&doc).unwrap()))
        .collect();

    Ok(data)
}

pub fn reload(&self) -> PyResult<()> {
    self.0.reload().map_err(to_pyerr)
}

}

#[pymethods] impl IndexUpdater { pub fn add(&mut self, input: &str, config: &InputConfig) -> PyResult<()> { self.0.add(input, &config.0).map_err(to_pyerr) }

pub fn update(&mut self, input: &str, config: &InputConfig) -> PyResult<()> {
    self.0.update(input, &config.0).map_err(to_pyerr)
}

pub fn commit(&mut self) -> PyResult<()> {
    self.0.commit().map_err(to_pyerr)
}

pub fn clear(&self) -> PyResult<()> {
    self.0.clear().map_err(to_pyerr)
}

}

#[pymethods] impl InputConfig { #[new] fn new( input_type: String, mapping: Option<Vec<(String, String)>>, conversion: Option<Vec<(String, (String, String))>>, ) -> PyResult { let input_type = match input_type.as_ref() { "yaml" | "yml" => x::InputType::Yaml, "json" => x::InputType::Json, "xml" => x::InputType::Xml, _ => return Err(exceptions::PyValueError::new_err("Invalid input type")), }; let conversion = conversion .unwrap_or_default() .into_iter() .filter_map(|(k, (t1, t2))| { let t = match (t1.as_ref(), t2.as_ref()) { ("string", "number") => (x::ValueType::String, x::ValueType::Number), ("number", "string") => (x::ValueType::Number, x::ValueType::String), _ => return None, }; Some((k, t)) }) .collect::<Vec<_>>();

    Ok(Self(x::InputConfig::new(
        input_type,
        mapping.unwrap_or_default(),
        conversion,
    )))
}

}

#[pymodule] fn xunmi(_py: Python, m: &PyModule) -> PyResult<()> { m.add_class::()?; m.add_class::()?; m.add_class::()?; Ok(()) }

整体的代码除了使用了一些 PyO3 提供的宏,没有什么特别之处,就是把 xunmi crate 的接口包装了一下Indexer/InputConfig/IndexUpdater然后把它们呈现在 pymodule 中。

你可以去这门课的 GitHub repo 里,下载可以用于测试的 fixtures以及 Jupyter Notebookindex_wiki.ipynb

如果要测试 Python 代码,请运行 make这样会编译出一个 release 版本的 .so 放在 xunmi 目录下,之后你就可以在 ipython 或者 jupyter-lab 里 from xunmi import * 来使用了。当然,你也可以使用第 6 讲介绍的 maturin 来测试和发布。

One more thing

作为一个 Python 老手,你可能会问,如果在 Python 侧,我要传入 *args变长参数 或者 **kwargs变长字典怎么办这可是 Python 的精髓啊别担心pyo3 提供了对应的 PyTuple/PyDict 类型,以及相应的宏。

我们可以这么写:

use pyo3::types::{PyDict, PyTuple};

#[pyclass] struct MyClass {}

#[pymethods] impl MyClass { #[staticmethod] #[args(kwargs = "**")] fn test1(kwargs: Option<&PyDict>) -> PyResult<()> { if let Some(kwargs) = kwargs { for kwarg in kwargs { println!("{:?}", kwarg); } } else { println!("kwargs is none"); } Ok(()) }

#[staticmethod]
#[args(args = "*")]
fn test2(args: &PyTuple) -> PyResult<()> {
    for arg in args {
        println!("{:?}", arg);
    }
    Ok(())
}

}

感兴趣的同学可以尝试一下(记得要 m.add_class 注册一下)。下面是运行结果:

In [6]: MyClass.test1()
kwargs is none

In [7]: MyClass.test1(a=1, b=2)
('a', 1) ('b', 2)

In [8]: MyClass.test2(1,2,3)
1 2 3

小结

PyO3 是一个非常成熟的让 Python 和 Rust 互操作的库。很多 Rust 的库都是通过 PyO3 被介绍到 Python 社区的。所以如果你是一名 Python 开发者,喜欢在 Jupyter Notebook 上开发,不妨把一些需要高性能的库用 Rust 实现。其实 tantivy 也有自己的 tantivy-py你也可以看看它的实现源码。

当然啦,这一讲我们对 PyO3 的使用也仅仅是冰山一角。PyO3 还允许你在 Rust 下调用 Python 代码。

比如你可以提供一个库给 Python让 Python 调用这个库的能力。在需要的时候,这个库还可以接受一个来自 Python 的闭包函数,让 Python 用户享受到 Rust 库的高性能之外,还可以拥有足够的灵活性。我们之前使用过的 polars 就有不少这样 Rust 和 Python 的深度交互。感兴趣的同学可以看看它的代码。

思考题

今天我们实现了 xunmi-py按照类似的思路你可以试着边看 neon 的文档,边实现一个 xunmi-js让它也可以被用在 Node.js 社区。

欢迎在留言区分享讨论。感谢你的收听今天你完成了第32次Rust打卡啦继续坚持。我们下节课见